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翎因生物ConA磁珠解锁CUT&Tag技术助力NGS

前不久,弗雷德哈钦森癌症研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公开了CUT&Tag(Cleavage Under Target & Tagmentation)技术的详细结果与实验方案。与以往的ChIP-Seq、pA-MNase等方法相比,CUT&Tag技术方法简便易行,信噪比高,重复性好,需要的细胞数量少至60个细胞,且有望将ChIP-Seq做到单细胞水平,再一次展现了创新技术方法的潜力。

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CUT&Tag技术是一种新兴的蛋白质-DNA互作研究方法,被用来替代传统的ChIP-Seq方法。CUT&Tag在高活性转座酶上融合了protein A/G抗体结合功能域,该功能域部分可以与靶向目的位点的抗体结合,使得Tn5转座酶在目的位点上被原位栓系,并且在目的位点附近进行打断的同时引入必要的接头序列,随后提取的DNA在经过PCR扩增后直接得到用于测序的文库。相比于被广泛应用的ChIP-Seq方法,CUT&Tag所需的细胞量更少,具有更高的信噪比和更好的可重复性。不需要进行甲醛交联固定和超声波打断,也不需要通过连接法添加测序接头,在简化操作、节省时间的同时,也提供了应用于单细胞测序研究的可能性。

该技术除了酶以外最重要的原料就是固定细胞的刀豆蛋白A(ConA)磁珠。通过将细胞固定在ConA磁珠上,简化了更换反应体系和连续洗涤的操作,可以实现一管式操作。实验流程从细胞收集到PCR文库构建的整个实验流程可以在一天内完成。

翎因生物自主研发的刀豆蛋白A(ConA)磁珠与国外知名公司产品相比,与糖蛋白结合量更高,对细胞损伤更小,非常适合CUT&Tag技术的使用。

翎因生物ConA磁珠解锁CUT&Tag技术助力NGS!



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